La Península de Baja California se divide en cinco distritos faunisticos de los cuales uno se localiza en Baja California Sur y los cuatro restantes se distribuyen en el Estado de Baja California

Distrito de San Pedro Martir

Es un estrecho cinturón que comprende las sierras de Juárez y San Pedro Mártir, a mas de 1,200 Km. en el lado occidental, y de 1,400 a 1,500 Km. en la vertiente oriental. Limita al norte con los Estados Unidos de América y llega a la altura de El Rosario. Algunas especies características de este distrito son: Borrego Cimarrón, Venado cola Blanca, Águila Ratonera o Halcón Cola Roja, Puna, y Zorra gris.

Distrito de San Pedro Martir

Ocupa la parte Sur del Estado, limita al Norte con el Distrito San Dieguense y el Distrito del Desierto del Colorado. Por el Pacifico se extiende hacia el Sur en forma de cuña, terminando en Punta Santo Domingo, en Baja California Sur. En su extensión se incluyen las mesetas graníticas características de la zona, además de la planicie volcánica del área de Calmallí Este distrito se distingue por el extraordinario desarrollo de la vegetación desértica. Algunas especies de este distrito son: Gato Montes y Borrego Cimarron.

Distrito San Dieguense

Ocupa la parte Noroeste de la Baja California, y representa una extensión del sur de California. Va desde el nivel del mar hasta los 1,200 Km. colindando con la Sierra de Juárez y hasta los 1,400 Km. con la sierra de San Pedro Mártir, para continuar al sur hasta el arroyo El Rosario.

Distrito del Desierto del Colorado

Cubre la parte Noroeste de Baja California, entre el nivel del mar y una altitud de 1,400 Km. En la frontera con la Sierra de Juárez, y 1,700 KM. -o mas- en la porción Este de la Sierra San Pedro Mártir. Su extremo Sur es la Bahía de Los Ángeles, desde Matomí y Punta San Fermín hacia el Sur y se extiende como una angosta franja, hacia el Este de la cadena montañosa, paralela a la costa. Hacia el Oeste, al sur de San Pedro Mártir limita con el Distrito San Dieguense. Su parte Norte ocupa la Planicie del Delta y las llanuras de inundación del río Colorado. Algunas de las especies de este distrito son: Codorniz, Borrego Cimarron, Murciélagos y conejos.